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Sequential Monte Carlo Filtering Estimation of Ebola Progression in West Africa

机译:西部埃博拉进展的序贯蒙特卡罗滤波估计   非洲

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摘要

We use a multivariate formulation of sequential Monte Carlo filter thatutilizes mechanistic models for Ebola virus propagation and available incidencedata to simultaneously estimate the disease progression states and the modelparameters. This method has the advantage of performing the inference online asthe new data becomes available and estimates the evolution of basicreproductive ratio $R_0(t)$ of the Ebola outbreak through time. Our analysisidentifies a peak in the basic reproductive ratio close to the time when Ebolacases were reported in Europe and the USA.
机译:我们使用顺序蒙特卡洛滤波器的多元公式,利用埃博拉病毒传播的机械模型和可用的发病率数据来同时估计疾病的进展状态和模型参数。该方法的优点是,随着新数据的获得,可以在线进行推断,并估算埃博拉疫情的基本繁殖率$ R_0(t)$随时间的变化。我们的分析确定了基本繁殖率的峰值,接近欧洲和美国报道的埃博拉酶病例的时间。

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